Dijkstra kreeg de onderscheiding vanwege twaalf jaar volksvertegenwoordiger zijn: vier jaar lid van Provinciale Staten van Gelderland (maart 2007 – maart 2011) en acht jaar lid van de gemeenteraad van Wageningen (maart 2018 – maart 2026). Hij werd benoemd tot Lid in de Orde van Oranje-Nassau.
Tijdens zijn raadslidmaatschap heeft Jan Dijkstra zich met volle overgave ingezet voor de raad en voor de stad. Omzien naar de ander, dat typeert Jan Dijkstra. Hij heeft zich in de raad ingezet voor het behoud van het Defilé op 5 mei en voor kinderen in Wageningen die in armoede leven. Jan Dijkstra vindt het belangrijk dat zij mee kunnen doen in de maatschappij.
Ook heeft hij zich hard gemaakt voor geschikte woonruimte voor senioren en voor Wageningse jongeren. Het laatste besluit van de gemeenteraad was het aannemen van een motie ingediend door Jan Dijkstra om Vluchtelingenwerk te ondersteunen.
In de raad was hij een bruggenbouwer. Jan Dijkstra bracht partijen samen en is omschreven als het kompas van de raad. Hij was lid van de agendacommissie, de werkgeverscommissie en van verschillende raadswerkgroepen (waaronder de werkgroep Integriteit en Democratische Kwaliteit).
